Strategies to recover blood donors during the COVID-19 pandemic: a tertiary level hospital experience / Estrategias para recuperar donantes de sangre durante la pandemia por COVID-19: experiencia de un hospital de tercer nivel

Abstract Background: The SARS-CoV-2 pandemic has challenged blood banks. In Mexico, donors decreased 22% between April and May 2020 compared to the same months in 2019. This study analyzed the effect of the strategies to recover donors (altruistic and family) in a tertiary pediatric care center during the pandemic. Methods: The Blood Bank of the Hospital Infantil de México Federico Gómez implemented strategies to obtain blood components to ensure self-sufficiency. The effect of these strategies on donor recovery was analyzed. Results: There were 7,315 eligible donors in 2019 and 5,070 in 2020. Blood component requirements decreased from 10,037 units in 2019 to 8,619 in 2020. The strategies aimed at attracting altruistic donors managed to increase the percentage of this type of donor when comparing the months in which these strategies were applied with the same months in 2019. In addition, it was observed that the greater the number of methods used simultaneously, the higher the percentage of altruistic donors (rho = 0.846, p = 0.002). In contrast, strategies aimed at attracting family donors did not increase the number of this type of donor. Conclusions: Actions to recruit altruistic donors increased the number of this type of donor to meet the hospital's needs.

Resumen Introducción: La pandemia por SARS-CoV-2 ha representado un reto en los bancos de sangre. En México, los donadores disminuyeron el 22% entre abril y mayo del 2020 en comparación con los mismos meses del 2019. Este estudio analizó el efecto de las estrategias realizadas para recuperar donantes, altruistas y familiares, en un centro de atención pediátrica de tercer nivel durante la pandemia. Métodos: El Banco de Sangre del Hospital Infantil de México Federico Gómez implementó estrategias encaminadas a la obtención de componentes sanguíneos para asegurar la autosuficiencia. Se analizó el efecto de dichas estrategias en la recuperación de donantes. Resultados: Se registraron 7,315 donadores aptos en el año 2019 y 5,070 en el 2020. Los requerimientos de componentes sanguíneos disminuyeron de 10,037 unidades en 2019 a 8,619 en 2020. Las estrategias que estaban destinadas a captar donadores altruistas lograron aumentar el porcentaje de este tipo de donadores al comparar los meses en que se aplicaron dichas estrategias con los mismos meses en el 2019. Además, se observó que, a mayor número de estrategias aplicadas de manera simultánea, mayor porcentaje de donadores altruistas (rho = 0.846, p = 0.002). Por el contrario, las estrategias con la finalidad de atraer donadores familiares no lograron aumentar la cantidad de este tipo de donadores. Conclusiones: Las acciones para recabar donadores altruistas aumentaron la cantidad de este tipo de donadores para satisfacer las necesidades del hospital.

Analytical recommendations for SARS-CoV-2 identification by RT-PCR in pediatric patients / Recomendaciones analíticas para la identificación de SARS-CoV-2 por RT-PCR en pacientes pediátricos

Abstract Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is caused by the severe acute respiratory syndrome 2 coronavirus (SARS-CoV-2) and is currently listed as a global public health emergency. Timely identification and protocol implementations for molecular detection of this virus are vital for medical decision-making. Identification of SARS-CoV-2 infection cases is based on detection of the virus RNA by molecular tests, particularly real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Technical and operational details specific to each center must be considered to perform the molecular diagnosis of SARS-CoV-2 in pediatric patients. The term “qualified laboratories” involves laboratories in which all users, analysts, and anyone reporting results are trained to develop and interpret results through a procedure implemented previously by an instructor. Such knowledge is essential in detecting and identifying errors during each of its phases: pre-analytical, analytical, and post-analytical, which allow the establishment of continuous improvement policies to ensure the quality of the results, but above all, the physical integrity of health workers.

Resumen La enfermedad por coronavirus de 2019 (COVID-19), causada por el coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2 (SARS-CoV-2), está catalogada actualmente como una emergencia de salud pública mundial. La oportuna identificación y la implementación de protocolos para la detección molecular de este virus son de vital importancia para la toma de decisiones médicas. La identificación de los casos de infección por SARS-CoV-2 se basa en la detección de ARN del virus mediante pruebas moleculares, específicamente la reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa (RT-PCR) en tiempo real. Existen detalles particulares de cada centro, tanto técnicos como operacionales, que deben considerarse para llevar a cabo el diagnóstico molecular de SARS-CoV-2 en pacientes pediátricos. El término «laboratorios calificados¼ se refiere a laboratorios en los cuales todos los usuarios, los analistas y cualquier persona que reporta resultados están capacitados para el desarrollo y la interpretación de estos a través de un procedimiento previo implementado por un instructor. Dichos conocimientos son indispensables para la detección y la identificación de errores durante el proceso en cada una de sus fases: preanalítica, analítica y posanalítica. Además, permiten establecer políticas de mejora continua que aseguran la calidad de los resultados, pero sobre todo la integridad física de los trabajadores de la salud.

Respiratory viral infections in pediatric patients with hematopoietic stem cell transplantation / Infecciones respiratorias virales en pacientes pediátricos con trasplante de células progenitoras hematopoyéticas

Abstract Background: Viral respiratory infections in pediatric patients with hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) significantly impact morbidity and mortality. It is necessary to determine the viral agents and their frequency of presentation to understand their impact on transplantation patients’ evolution. Methods: From January 2017 to December 2019, we conducted a cross-sectional, descriptive, and observational study of patients who underwent HSCT with a viral respiratory infection. Viral identification was performed using multiplex polymerase chain reaction for nine respiratory viruses. Descriptive statistics were performed with a report of central tendency measures and percentages. Results: Of the 54 pediatric patients who underwent HSCT, 59.2% presented an airway infection; in turn, at least one viral agent was identified in 59.3% of these patients. The most frequent viral agents were influenza (25.9%), human rhinovirus (18.5%), and respiratory syncytial virus (18.5%). Viral co-infections occurred in 36.8% of the cases. The reported complications were supplemental oxygen requirement (73.6%), support with mechanical ventilation (21%), admission to the pediatric intensive care unit (15.7%), and mortality associated with a viral respiratory infection (10.5%). Conclusions: Viral respiratory infections are frequent in pediatric patients with HSCT; influenza A/B virus was the most frequent agent. As morbidity and mortality increase due to these infections in patients with HSCT, strategies are necessary for its prevention and timely treatment after transplantation.

Resumen Introducción: Las infecciones respiratorias virales en los pacientes pediátricos con trasplante de células progenitoras hematopoyéticas (TCPH) impactan significativamente la morbilidad y la mortalidad. Para comprender su impacto en la evolución de los pacientes receptores de trasplantes es necesario conocer la frecuencia de presentación y los agentes virales. Métodos: De enero de 2017 a diciembre de 2019 se llevó a cabo un estudio transversal, descriptivo y observacional de los pacientes sometidos a TCPH que tuvieron una infección viral de vías respiratorias. La identificación de los virus se realizó por medio de la prueba de reacción en cadena de la polimerasa multiplex para nueve virus respiratorios. Se realizó estadística descriptiva con reporte de medidas de tendencia central y porcentajes. Resultados: De los 54 pacientes incluidos, el 59.2% presentaron una infección de vías respiratorias y se identificó al menos un agente viral en el 59.3% de estos casos. Los virus más frecuentes fueron influenza (25.9%), rinovirus humano (18.5%) y virus sincitial respiratorio (18.5%). En el 36.8% de los casos se detectaron coinfecciones virales. Se presentaron las siguientes complicaciones: requerimiento de oxígeno suplementario (73.6%), soporte con ventilación mecánica (21%), ingreso a la unidad de cuidados intensivos pediátricos (15.7%) y muerte asociada a infección por virus respiratorios (10.5%). Conclusiones: Las infecciones respiratorias virales en los pacientes pediátricos con TCPH son frecuentes; el virus influenza A/B es el agente más habitual. Debido a que estas infecciones se asocian con mayor morbimortalidad en los pacientes con TCPH, son estrategias necesarias para su prevención y tratamiento oportuno posterior al trasplante.

Risk conditions in healthcare workers of a pediatric COVID center in Mexico City / Condiciones de riesgo en el personal de salud de un centro COVID pediátrico de la Ciudad de México

Abstract Background: The new evere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is characterized by its high capacity to transmit. Health-care personnel is highly susceptible to becoming infected. This study aimed to determine the characteristics and known risk factors for contagion and severe outcomes of SARS-CoV-2 disease in health-care personnel of a pediatric coronavirus disease (COVID) center in Mexico City. Methods: In the last week of March 2020 (at the beginning of phase 2 of the Ministry of Health's national campaign in Mexico), a study was conducted on healthcare workers of a pediatric COVID hospital in Mexico City. Using a virtual interview, we evaluated comorbidities, mobility, areas and functions where they carry out the activities, protection measures, contact history, and vaccination. According to their activities, healthcare workers were classified into the following areas: medical, nursing, other health-care personnel (researchers, nutritionists, rehabilitation, imaging, and laboratory), administrative, and other services. We compared the variables between the groups of healthcare workers with the X2 test. Results: We included 812 participants. The mean age was 41 ± 11 years, and 33% were overweight or obese, 18% were over 60 years old, and 19% had high blood pressure. Medical and nursing personnel presented a higher proportion in the use of standard protection measures. Conclusions: Among healthcare workers, there are risk conditions for the development of complications in case of SARS-CoV-2 infection. Most medical and nursing personnel use standard protective measures.

Resumen Introducción: La pandemia por el nuevo coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2) se caracteriza por su alta capacidad de transmitirse, por lo que el personal de salud es muy susceptible de contagiarse. El objetivo de este estudio fue determinar las características y los factores de riesgo conocidos para el contagio y los desenlaces graves de la enfermedad por SARS-CoV-2 en personal de salud de un centro COVID pediátrico de la Ciudad de México. Método: La última semana de marzo de 2020 (al inicio de la fase 2 de la campaña nacional por coronavirus en México) se realizó un estudio en los trabajadores de la salud de un hospital COVID pediátrico de la Ciudad de México. Mediante una entrevista virtual se evaluaron comorbilidad, movilidad, área y funciones donde se desempeñan las actividades laborales, medidas de protección, antecedentes de contactos y vacunación. Los participantes fueron clasificados en las siguientes áreas: personal médico, enfermería, otro personal de salud (investigadores, nutriólogos, rehabilitación, imagenología, laboratorio), administrativo y otros servicios. Se realizaron comparaciones de las variables con prueba de X2 entre los grupos de trabajadores de la salud Resultados: Se incluyeron 812 participantes. El 33% presentó sobrepeso u obesidad, el 18% eran mayores de 60 años y el 19% tenía hipertensión arterial. El personal médico y de enfermería mostró una mayor proporción de uso de medidas de protección estándar. Conclusiones: Existen condiciones de riesgo para el desarrollo de complicaciones en los trabajadores de la salud en caso de contagio con SARS-CoV-2. La mayoría del personal médico y de enfermería utiliza las medidas de protección estándar.

Acute myeloid leukemia associated with t(16:21)(p11;q22) in a pediatric patient / Leucemia mieloide aguda asociada con t(16:21)(p11;q22) en un paciente pediátrico

Abstract Background: Rare subgroups of pediatric patients with acute myeloid leukemia (AML), such as t(16:21) (p11;q22), require international cooperation to establish a proper stratification system to assign clinical risk. Case report: Here, we report a 13-year-old female who was admitted for asthenia, fatigue, and intermittent fever. The hematological data showed thrombocytopenia and anemia, and the bone marrow test showed 82.5% blast cells, which were positive for CD13, CD33, CD38, and CD117. Blast cells showed negative myeloperoxidase staining and positive periodic acid-Schiff staining. A diagnosis of AML M6 was made. Cells were positive for the fusion transcript FUS-ERG t(16;21)(p11;q22). The patient achieved morphological remission. However, molecular remission was not achieved, and she died 11 months after diagnosis. Conclusions: It is essential to report this sporadic case of AML to provide clinicians with data for clinical decision-making, such as for risk-group stratification. To the best of our knowledge, this is the first association between this translocation and this morphological subtype.

Resumen Introducción: La leucemia mieloide aguda (LMA) infantil es una enfermedad heterogénea, por lo que existen subgrupos de rara presentación, como aquellos con t(16;21)(p11;q22). Para establecer el riesgo clínico y la estratificación pronóstica adecuada es necesaria la cooperación internacional. Caso clínico: Se reporta el caso de una adolescente de 13 años, admitida por astenia, adinamia y fiebre intermitente. Los datos hematológicos mostraron trombocitopenia y anemia, con un 82.5% de blastos en médula ósea, los cuales fueron positivos para CD13, CD33, CD38 y CD 117. Los blastos fueron negativos para mieloperoxidasa y positivos para ácido peryódico de Schiff. Se realizó el diagnóstico morfológico de LMA M6. Las células fueron positivas para el transcrito FUS-ERG t(16;21)(p11;q22). La paciente alcanzó la remisión morfológica; sin embargo, no fue posible la remisión molecular y falleció 11 meses después del diagnóstico. Conclusiones: Es importante reportar casos en los que se identifique un subtipo muy raro de LMA infantil para incrementar la evidencia clínica y contribuir con elementos que ayuden a tomar decisiones clínicas y lograr la estratificación en grupos de riesgo. Hasta la fecha, este el primer caso reportado en que se asocia el transcrito t(16;21)(p11;q22) con el subtipo morfológico LMA M6.

Clinical risk profile associated with SARS-CoV-2 infection and complications in the emergency area of a pediatric COVID-19 center / Perfil clínico de riesgo asociado a infección y complicaciones por SARS-CoV-2 en el área de urgencias de un centro pediátrico COVID-19

Abstract Background: In February 2020, the disease caused by the novel coronavirus (SARS-CoV-2), was classified as a pandemic. In the pediatric population, coronavirus disease (COVID)-19 has a reported mortality of less than 6% in complicated cases; however, the clinical characteristics and severity are not the same as those presented in the adult population. This study aimed to describe the clinical manifestations of patients younger than 18 years old and their association with the confirmation of the test and outcomes. Methods: We conducted an analytical cross-sectional study of symptoms suggestive for SARS-CoV-2 infection. All subjects with a confirmatory test for SARS-CoV-2 were included. Initial symptoms, history of influenza vaccination, and previous contact were documented, and mortality and the requirement for assisted mechanical ventilation were identified. The proportions of the variables were compared with the χ2 test. The odds ratio for a positive test and the requirement of intubation was calculated. Results: Of a total of 510 subjects, 76 (15%) were positive for SARS-CoV-2. The associated symptoms were chest pain, sudden onset of symptoms, and general malaise. The variable most associated with contagion was the exposure to a relative with a confirmed diagnosis of COVID-19. Infants and subjects without the influenza vaccine showed an increased risk for respiratory complications. Conclusions: The frequency of positivity in the test was 15% (infants and adolescents represented 64% of the confirmed cases), and the associated factors identified were contact with a confirmed case, sudden onset of symptoms, and chest pain.

Resumen Introducción: En 2019 se reportaron los primeros casos de SARS-CoV-2 (coronavirus tipo 2 del síndrome respiratorio agudo grave), causante de la COVID-19, que alcanzó el grado de pandemia en febrero de 2020. La presentación en la etapa pediátrica reporta una mortalidad menor del 6% en los casos complicados; sin embargo, las características clínicas y su gravedad no son iguales que en la población adulta. El objetivo de este estudio fue describir las manifestaciones clínicas de los pacientes menores de 18 años y su asociación con la confirmación de la prueba, la intubación endotraqueal y la muerte. Métodos: Estudio transversal analítico por cuadro sugestivo de infección por SARS-CoV-2. Se incluyeron sujetos positivos para SARS-CoV-2. Se documentaron los síntomas iniciales, los antecedentes de vacunación contra la influenza y los contactos previos, y se identificaron los desenlaces de mortalidad y requerimiento de ventilación mecánica asistida. Se compararon las proporciones de las variables con la prueba χ2 y se calculó la razón de momios para la presencia de una prueba positiva y requerir intubación. Resultados: De un total de 510 sujetos, 76 (15%) fueron positivos para SARS-CoV-2. Los síntomas asociados fueron dolor precordial, inicio súbito y malestar general. La variable asociada con mayor frecuencia el contagio fue la exposición a un familiar con COVID-19 confirmada. Los sujetos sin vacuna de la influenza presentaron un riesgo mayor de complicaciones respiratorias. Conclusiones: La frecuencia de positividad en la prueba fue del 15%. Se identificaron como factores asociados a prueba positiva el contacto con un caso confirmado de COVID-19, el inicio súbito de los síntomas y el dolor precordial.

Saliva as a promising biofluid for SARS-CoV-2 detection during the early stages of infection / La saliva como biofluido promisorio para la detección del SARS-CoV-2 durante las primeras etapas de la infección

Abstract Background: Diagnostic testing for coronavirus disease (COVID)-19 is performed using nasopharyngeal swabs. This type of sampling is uncomfortable for the patient, dangerous for health workers, and its high demand has led to a global shortage of swabs. One of the alternative specimens is saliva. However, the optimal conditions for the test have not been established. Methods: Reverse transcription-polymerase chain reaction was used to detect the viral genome in saliva samples kept at room temperature, in the fridge or frozen for 2 days. In addition, the influence of brushing teeth and feeding on the detection of the virus in saliva was addressed. Finally, the efficiency of saliva in revealing the presence of the virus during the hospitalization period was determined in children. Results: The viral genome was consistently detected regardless of the storage conditions of saliva samples. Brushing teeth and feeding did not influence the sensitivity of the test. In hospitalized children, positive results were obtained only during the early days. Conclusions: These results support the idea of the use of saliva as an alternative specimen for diagnostic testing for COVID-19. The viral genome is stable and endures perturbations in the oral cavity. However, clearance of the virus from the mouth during the infection may limit the use of the test only to the early stages of the disease.

Resumen Introducción: El diagnóstico de COVID-19 (enfermedad por coronavirus 2019) se realiza con un hisopado nasofaríngeo. El procedimiento de toma de muestra es molesto para el paciente y peligroso para el personal de salud, y la alta demanda de análisis ha conducido a la escasez de hisopos. Una alternativa es el uso de saliva, pero las condiciones óptimas para realizar el estudio no han sido establecidas. Métodos: Se usó la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa reversa para detectar el genoma viral en muestras de saliva mantenidas a temperatura ambiente, en refrigeración o congeladas. Además, se evaluó la influencia del aseo bucal y de la ingesta de alimento en la detección del virus. Finalmente, se determinó el desempeño de la saliva para reportar la presencia del virus durante el periodo de hospitalización en niños. Resultados: El genoma viral fue estable durante 2 días a las diferentes temperaturas ensayadas. El aseo bucal y la ingesta de alimento no influyeron en la detección del virus. En los niños hospitalizados solo se obtuvieron resultados positivos durante los primeros días. Conclusiones: Los resultados coinciden con la idea del uso de la saliva como biofluido alternativo para el diagnóstico de COVID-19. El genoma viral es estable y no se ve afectado por perturbaciones en la cavidad oral; sin embargo, la dinámica de la infección puede provocar que el ensayo solo sea útil durante las primeras etapas de la enfermedad.

Reconstitución de células natural killer después del trasplante de células progenitoras hematopoyéticas en niños / Natural killer cell reconstitution after hematopoietic stem-cell transplantation in children

Resumen Introducción: Después de un trasplante de células progenitoras hematopoyéticas (TCPH), la reconstitución de las células natural killer (NK) es la principal barrera contra las infecciones virales. Objetivo: Determinar que el conocimiento sobre la cinética de la reconstitución de las células NK posterior al TCPH contribuye a un eficiente monitoreo del trasplante, lo que incrementa la posibilidad de éxito de este. Método: Se incluyeron 21 pacientes sometidos a TCPH, así como un grupo control de individuos clínicamente sanos. En diferentes momentos después del trasplante (intervalo de 21 a 670 días), mediante citometría de flujo se cuantificaron las células NK CD3− CD16+ CD56+ en muestras de sangre periférica. Resultados: La recuperación de las células NK ocurre entre los tres y seis meses y entre los 10 y 12 meses postrasplante; su número fue significativamente menor (en comparación con el grupo control) en el tiempo restante del monitoreo. Conclusiones: El primer periodo de recuperación de las células NK ocurre entre los tres y seis meses posteriores al trasplante. La reconstitución es transitoria y el número de células NK varía en los primeros años.

Abstract Introduction: After hematopoietic stem cell transplantation (HSCT), natural killer (NK) cells reconstitution is the main barrier against viral infections. Objective: To determine that the knowledge on the kinetics of NK cell reconstitution after HSCT contributes to transplant efficient monitoring, which increases the possibility of its success. Method: Twenty-one patients undergoing HSCT were included, as well as a control group of clinically healthy individuals. At different time points after transplantation (range of 21 to 670 days), CD3- CD16+ CD56+ NK cells were quantified by flow cytometry in peripheral blood samples. Results: NK cell recovery occurs at three to six months and 10 to 12 months post-transplantation; their number was significantly lower (in comparison with the control group) in the rest of the monitoring time. Conclusions: The first period of NK cell recovery occurs between three and six months after transplantation. Reconstitution is transient and the number of NK cells varies in the first years.

Determinación y cuantificación de subpoblaciones de linfocitos T y células natural killer en sangre periférica de individuos sanos por citometría de flujo / Detection and quantification of T-cell subpopulations and NK cells in peripheral blood from healthy individuals

Resumen Introducción: La determinación de las diferentes subpoblaciones de los linfocitos T en las diversas patologías y el monitoreo postratamiento ayuda a que el médico tome decisiones terapéuticas teniendo como referencia la cinética de los linfocitos T localizados en sangre periférica. Métodos: Se realizó la estandarización de un perfil de moléculas de superficie para la caracterización de subpoblaciones de linfocitos T: naïve, activados y de memoria, así como las células natural killer o asesinas naturales (CD3− CD56+) en sangre periférica de individuos clínicamente sanos. Resultados: Se identificaron las subpoblaciones de linfocitos: naïve (CD3+, CD4+ o CD8+, CD45RA+, CD62L+, CCR7+), activados (CD3+, CD4+ o CD8+, CD45RA+ o CD45RO+, CD69+ y/o CRTAM+), efectores (CD3+, CD4+ o CD8+, CD45RA+, CD62L−, CCR7−), de memoria central (CD3+, CD4+ o CD8+, CD45RO+, CD62L+, CCR7+) y de memoria efectora (CD3+, CD4+ o CD8+, CD45RO+, CD62L−, CCR7−) en las poblaciones de linfocitos T CD4+ y CD8+. Se integraron los datos obtenidos con estadística descriptiva (valores mínimos, valores máximos, media, mediana). Conclusiones: Este panel será de gran utilidad para monitorear pacientes en quienes se requiera valorar el estado inmunológico desde el punto de vista celular. Particularmente, puede apoyar en el seguimiento de los pacientes en los que se requiera evaluar la reconstitución inmunológica (componente celular de estirpe T).

Abstract Background: The knowledge of the participation of different subpopulations of T lymphocytes in various pathologies helps to make therapeutic decisions, having as reference the presence of the different subpopulations of the T lymphocytes associated with the disease. Methods: A profile standardization of surface molecules for the characterization of subpopulations of T cells was conducted: naïve, activated and memory, as well as natural killer (CD3− CD56+) cells in peripheral blood of clinically healthy individuals. Results: Naïve (CD3+, CD4+ or CD8+, CD45RA+, CD62L+, CCR7+), activated (CD3+, CD4+ or CD8+, CD45RA+ or CD45RO+, CD69+ and/or CRTAM+), effectors (CD3+, CD4+ o CD8+, CD45RA+, CD62L−, CCR7−), central memory (CD3+, CD4+ o CD8+, CD45RO+, CD62L+, CCR7+), memory effectors (CD3+, CD4+ or CD8+, CD62RO+, CD62L−, CCR7−) subpopulations were analyzed by flow cytometry. Descriptive statistics parameters were calculated (minimum values, maximum values, mean values, median). Conclusions: This panel can be very useful for monitoring patients in whom the immunological status from a cellular perspective is needed. Particularly, it can support the follow-up of patients who require an immunological reconstitution (T-cell component) evaluation.

Omics techniques and biobanks to find new biomarkers for the early detection of acute lymphoblastic leukemia in middle-income countries: a perspective from Mexico / Técnicas ómicas y biobancos para el hallazgo de nuevos biomarcadores para la detección temprana de leucemia linfoblástica aguda en países de ingresos medios: una perspectiva mexicana

Abstract: Acute lymphoblastic leukemia (ALL) affects the quality of life of many children in the world and particularly in Mexico, where a high incidence has been reported. With a proper financial investment and with well-organized institutions caring for those patients, together with solid platforms to perform high-throughput analyses, we propose the creation of a Mexican repository system of serum and cells from bone marrow and blood samples derived from tissues of pediatric patients with ALL diagnosis. This resource, in combination with omics technologies, particularly proteomics and metabolomics, would allow longitudinal studies, offering an opportunity to design and apply personalized ALL treatments. Importantly, it would accelerate the development of translational science and will lead us to further discoveries, including the identification of new biomarkers for the early detection of leukemia.

Resumen: La leucemia linfoblástica aguda (LLA) afecta la calidad de vida de una gran cantidad de individuos en edad pediátrica en todo el mundo; particularmente en México, donde se ha reportado una alta incidencia. Con un apropiado fondo de inversión financiera, así como instituciones adecuadamente organizadas al cuidado de los pacientes con LLA, en conjunto con plataformas sólidas para llevar a cabo análisis globales y de alto rendimiento, se propone la creación de un repositorio para la conservación de suero y células provenientes de médula ósea y sangre derivadas de pacientes pediátricos con LLA al diagnóstico. Estos recursos, en combinación con las tecnologías ómicas, en particular la proteómica y la metabolómica, podrían permitir el establecimiento de estudios longitudinales y ofrecer una oportunidad para el diseño y aplicación de tratamientos personalizados para la LLA. Esta estrategia permitiría acelerar el desarrollo de la ciencia traslacional, favoreciendo el hallazgo de importantes descubrimientos, incluyendo la identificación de nuevos biomarcadores para la detección temprana de la leucemia.

Alveolar rhabdomyosarcoma: origin and prognostic implications of molecular findings / Rabdomiosarcoma alveolar: origen de los hallazgos moleculares e implicaciones pronósticas

Abstract: We present the case of a 2-year-old male patient with a facial tumor partially treated with chemotherapy before his admission to our institution. The tumor involved from the frontal region to the maxillary floor, the orbit, and the maxillary and sphenoid sinuses. The histopathological diagnosis revealed a stage IV alveolar rhabdomyosarcoma with infiltration to bone marrow and cerebrospinal fluid. He was managed with four cycles of adriamycin, actinomycin, cyclophosphamide and vincristine; cisplatin and irinotecan were added to the last cycle. The tumor had a 50% size reduction, but the patient died after a neutropenia and fever episode. The aggressive behavior of alveolar rhabdomyosarcoma has been associated with the expression of oncogenic fusion proteins resulting from chromosomal translocations, particularly t(2;13) (q35;q14) PAX3/FOXO1, and t(1;13) (p36;q14) PAX7/FOXO1 which were present in this patient.

Resumen: Se presenta el caso de un niño de dos años de edad con un tumor facial tratado parcialmente con quimioterapia anterior a su admisión en este hospital. El tumor abarcaba desde la región frontal hasta el piso maxilar, la órbita y los senos esfenoidales y maxilares. El diagnóstico histopatológico reveló un rabdomiosarcoma alveolar estadio IV con infiltración a la médula ósea y fluido cerebroespinal. El paciente fue tratado con cuatro ciclos de adriamicina, actinomicina, ciclofosfamida y vincristina; al último ciclo se añadieron cisplatino e irinotecan. El tumor se redujo en 50% de su tamaño, pero el paciente murió tras un episodio febril y neutropénico. La agresividad del rabdomiosarcoma alveolar se ha asociado con la expresión de proteínas oncogénicas de fusión provenientes de translocaciones cromosomales, particularmente t(2;13) (q35;q14) PAX3/FOXO1 y t(1;13) (p36;q14) PAX7/FOXO1, presentes en este paciente.

Correlation between viral load of cytomegalovirus and tacrolimus and sirolimus levels in transplanted pediatric patients / Correlación entre la carga viral de citomegalovirus y los niveles de tacrolimus y sirolimus en pacientes pediátricos trasplantados

Abstract: Introduction: Survival of transplant patients and grafts depends largely on the use of immunosuppressive drugs. However, a balance remains to be established among immunosuppression, transplant rejection and cytomegalovirus (CMV) infection, which results in a high rate of morbidity and mortality. The aim of this study was to define a better strategy for monitoring transplanted patients based on the analysis of the blood concentration of sirolimus and tacrolimus and the burden of CMV. Methods: Fifty five post-transplant (kidney and liver) pediatric patients, nine treated with sirolimus and 46 treated with tacrolimus, were included. A total of 541 measurements were obtained. In each measurement the concentration of immunosuppressant in whole blood and CMV viral load in plasma and whole blood was quantified by real-time PCR. Pearson correlation coefficient (r) was estimated. Results: Values of r ≤ 0.0747 were found for the relationship between dose and concentration of immunosuppressant; r = 0.9406 for the relationship between viral load in whole blood and plasma, and r ≤ 0.4616 for the relationship between concentration of immunosuppressant and viral load. Conclusions: These data support that the doses of immunosuppressive drugs do not correlate with the levels of the same in whole blood. Therefore, systemic levels of immunosuppressant should be constantly monitored together with CMV load. Meanwhile, a high correlation between viral load measured in whole blood and plasma was found.

Resumen: Introducción: La supervivencia de pacientes trasplantados y de los injertos depende en gran medida del uso de fármacos inmunosupresores. Sin embargo, aún no se ha logrado establecer un balance entre la inmunosupresión, el rechazo al trasplante y la infección por citomegalovirus (CMV), lo cual deriva en una alta tasa de morbilidad y mortalidad. El objetivo de este trabajo fue definir una mejor estrategia de seguimiento de los pacientes trasplantados a partir del análisis de la concentración en sangre de sirolimus y tacrolimus y la carga de CMV. Métodos: Se incluyeron 55 pacientes pediátricos post-trasplante (riñón e hígado), nueve en tratamiento con sirolimus y 46 en tratamiento con tacrolimus. Se obtuvieron 541 mediciones en total. En cada medición se cuantificó la concentración de inmunosupresor en sangre total y la carga viral de CMV en plasma y sangre total mediante PCR en tiempo real. Se calculó el coeficiente de correlación de Pearson (r). Resultados: Se encontraron valores de r ≤ 0.0747 para la relación entre dosis y concentración del inmunosupresor; de r = 0.9406 para la relación de la carga viral entre suero y sangre total y de r ≤ 0.4616 para la relación entre concentración de inmunosupresor y carga viral. Conclusiones: Estos datos apoyan que la dosis de los fármacos inmunosupresores no correlaciona con los niveles de los mismos en sangre total. Por ello, deben ser constantemente monitoreados junto con la carga viral. Por su parte, se encontró alta correlación entre la carga viral medida en sangre total y plasma.

Transición parasitaria: experiencia en un hospital pediátrico de tercer nivel (1990-2010) / Parasitological transition: Experience in a third-level pediatric hospital (1990-2010)

ResumenINTRODUCCIÓN: Hace algunos años, el motivo principal para la solicitud del diagnóstico parasitológico era la sospecha de una etiología de base parasitaria. En la actualidad, el motivo de consulta y la solicitud del diagnóstico se encuentran asociados con una comorbilidad hemato-oncológica, autoinmune, inmunodeficiente o una condición postrasplante.MÉTODO: Se analizaron los resultados del laboratorio de parasitología clínica del Hospital Infantil de México Federico Gómez de enero de 1990 a diciembre del 2010, para obtener la frecuencia y distribución de parásitos y comensales por año y década.RESULTADOS: Se analizaron 211,600 muestras del periodo estudiado, con una media anual de 10,100 y desviación estándar de 3,500. El porcentaje de parásitos y comensales fue del 37.73%, y la frecuencia de positividad solo a parásitos fue del 21.4%. La diferencia de proporciones entre décadas resultó significativa, con una p < 0.0001.CONCLUSIONES: La tendencia en el comportamiento de las parasitosis intestinales durante el periodo estudiado mostró un cambio tanto en frecuencia como en género y especie de los agentes reportados. La generación de información de carácter epidemiológico es necesaria para conocer la tendencia de las parasitosis y de sus variaciones a través del tiempo.

AbstractBACKGROUND: In recent years, the main reason for parasitological diagnosis was suspicion of a parasitic etiology. Currently, diagnosis and consultation are associated with co-morbidity with a hemato-oncological, autoimmune, immunodeficiency or post-transplant condition.METHODS: Results collected from the Parasitology Laboratory of the Hospital Infantil de Mexico Federico Gómez from January 1990 to December 2010 were analyzed to determine the frequency and distribution of parasites and commensals per year and decade.RESULTS: There were 211,600 samples analyzed with a statistical media of 10,100 and a standard deviation of 3,500 samples. Percentage of observations for parasitic structures as well as commensals was 37.73% according to Pearson Chi square with a significant difference among percentages between decades (p < 0.0001).CONCLUSIONS: Behavioral tendency of intestinal parasitosis during the last two decades shows a change in frequency and genera from the agents that were reported at this pediatric health care level. The processing of epidemiologic information is important in order to determine the response of the parasitosis and its variations over time.

Cistatina C como prueba de rutinapara evaluar la función renal en pacientes pediátricos / Cystatin C as a routine test to evaluate kidney function in pediatric patients

Numerosos estudios han demostrado que los niveles plasmáticos de cistatina C tienen más exactitud que los de creatinina en la estimación de la tasa de filtración glomerular (eTFG). Sin embargo, no se utiliza como prueba rutinaria en el diagnóstico de patologías renales pediátricas. El objetivo de este estudio fue comparar la TFG para cistatina C en pacientes pediátricos mexicanos con y sin exposición a factores de riesgo para presentar Insuficiencia Renal Aguda (IRA) y corroborar las ventajas de emplear este marcador en el diagnóstico oportuno de patologías renales en relación con la creatinina. Se analizaron 106 muestras para estimar la TFG. Se cuantificó la concentración de creatinina y cistatina C, sustituyendo los valores en las fórmulas MDRD v-4 y Filler y Lepage, respectivamente. Se compararon las concentraciones tanto de creatinina como de cistatina entre los grupos de estudio por medio de U de Mann Whitney. Asimismo, se evaluó la correlación entre estos dos metabolitos divididos por presencia o no de factores de riesgo para presentar la enfermedad renal. Se observó una correlación entre las concentraciones de creatinina y cistatina C sérica, tanto en el grupo de pacientes sin factores de riesgo para IRA (r=0,936, p<0,001) como en los que sí presentaron factores de riesgo para IRA (r=0,952, p<0,001).El grupo con factores de riesgo mostró concentraciones mayores tanto de cistatina como de creatinina, así como de eTFG para ambos metabolitos. La cistatina C muestra una buena correlación con la creatinina. Por otro lado,la cistatina alterada identificó a un mayor número de pacientes con factores de riesgo para IRA, por lo cual se propone su uso como prueba de escrutinio en pacientes pediátricos...

Susceptibilidad antimicrobiana de microorganismos causantes de infección de vías urinarias bajas en un hospital pediátrico / Antimicrobial susceptibility of uropathogens from uncomplicated urinary tract infection in a pediatric hospital

Introducción: La infección del tracto urinario en los niños es reconocida como una causa de morbilidad y de condiciones médicas crónicas, por lo que resulta indispensable conocer con claridad la patogénesis de esta enfermedad. Sin embargo, la resistencia creciente complica su tratamiento ya que aumenta la morbilidad, los costos, la estancia hospitalaria y el uso de fármacos de mayor espectro antimicrobiano. El propósito de este estudio fue determinar la susceptibilidad antimicrobiana de los uropatógenos aislados en niños. Métodos: Se incluyeron en el estudio 457 niños que asistieron a la consulta externa y a urgencias del Hospital Infantil de México Federico Gómez, con síntomas de infección del tracto urinario baja no complicada. La orina fue tomada a la mitad del chorro o por cateterismo, y se realizó la identificación y la susceptibilidad antimicrobiana. Resultados: Los patógenos aislados con mayor frecuencia fueron: Escherichia coli (E. coli) (312, 68.3%), Enterococcus spp. (42, 11%), Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) (40, 8.7%), Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) (34, 7.5%), Proteus mirabilis (P. mirabilis) (21, 4.5%), Enterobacter cloacae (8, 1.7%). La resistencia para trimetoprima/sulfametoxazol fue del 73.7, 62.2, 100, 52, 50%,respectivamente, para E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa, P. mirabilis y Enterobacter spp., del 92.5% para Enterococcus faecalis (E. faecalis) y del 49.9% para Enterococcus faecium (E. faecium). Para ampicilina fue del 86.3, 45, 100, 47.9 y 66.6% para las mismas bacterias, respectivamente. Para ciprofloxacina del 33.8, 9, 18.8, 0 y 0%; para nitrofurantoína del 4.4, 13, 97.7, 70, 0% para enterobacterias, del 0% para E. faecalis y del 16.7% para E. faecium. Conclusiones: Los antimicrobianos frecuentemente prescritos para el tratamiento empírico de la infección del tracto urinario no complicada demuestran resistencia importante o baja susceptibilidad cuando se les probó frente a las cepas aisladas.

Background: Urinary tract infection in children is well recognized as a cause of acute morbidity and chronic medical conditions. As a result, appropriate use of antimicrobial agents, however, increases antibiotic resistance and complicates its treatment due to increased patient morbidity, costs, rates of hospitalization, and use of broader-spectrum antibiotics. The goal of this study was to determine antibiotic susceptibility to commonly used agents for urinary tract infection against recent urinary isolates. Methods: A total of 457 consecutive children attending the emergency room at the Hospital Infantil de México Federico Gómez with symptoms of uncomplicated lower urinary tract infection were eligible for inclusion. Patients who had had symptoms for ≥ 7 days and those who had had previous episodes of urinary tract infection, received antibiotics or other complicated factors were excluded. Midstream and catheter urine specimens were collected. All isolates were identified and the in vitro activities of antimicrobials were determined. Results: The most frequently isolated urinary pathogens were as follows: Escherichia coli (E. coli) (312, 68.3%), Enterococcus spp. (42, 11%), Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) (40, 8.7%), Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) (34, 7.5%), Proteus mirabilis (P. mirabilis) (21, 4.5%), Enterobacter cloacae (8, 1.7%). The resistance to trimetoprim/sulfametoxazol (%) was 73.7, 62.2, 100, 52, and 50, respectively, for E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa, P. mirabilis and Enterobacter spp., 92.5 for Enterococcus faecalis (E. faecalis) and 49.9 for Enterococcus faecium (E. faecium). Ampicillin was 86.3, 45, 100, 47.9, and 66.6% for the same strains, ciprofloxacin 33.8, 9, 18.8, 0, 0%, nitrofurantoin 4.4, 13, 97.7, 70, 0%; to E. faecalis 0% and 16.7% to E. faecium. Conclusions: Frequently prescribed empirical agents for uncomplicated urinary tract infection demonstrate lowered in vitro susceptibilities when tested against recent clinical isolates.

Vigilancia institucional de la susceptibilidad antimicrobiana en patógenos de interés clínico / Institutional vigilance of antimicrobial susceptibility in pathogens of clinical interest

Introducción. El incremento en la resistencia de los microorganismos a los antibióticos ha provocado un aumento en la morbimortalidad de las infecciones, un mayor uso de antibióticos y el exceso en gastos de hospitalización. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo fue describir la frecuencia de microorganismos patógenos y sus patrones de susceptibilidad bacteriana en cultivos de sangre, orina y de otros fluidos corporales en un hospital pediátrico de tercer nivel. Métodos. Se incluyeron en el estudio cepas de cultivos de sangre, orina, líquido cefalorraquídeo y otros, como pleural, pericárdico y peritoneal, de enero de 2010 a junio de 2011. La identificación y la susceptibilidad se obtuvieron utilizando el equipo Vitek 2XL, de acuerdo con las recomendaciones del Clinical and Laboratory Standards Institute . Resultados. Se aislaron e identificaron 7708 bacterias de 27,209 cultivos de muestras biológicas. Los microorganismos más frecuentes fueron Staphylococcus coagulasa negativa, Escherichia coli, Enterococcus spp, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa y Klebsiella pneumoniae . La actividad antimicrobiana en contra de los diferentes patógenos fue variable. Escherichia coli presentó la mayor resistencia a trimetoprima-sulfametoxazol (74%) y ampicilina-sulbactam (68%). Las mejores opciones resultaron nitrofurantoína e imipenen, con 84 y 100% de sensibilidad. La resistencia de Enterococcus faecium fue de 58% a vancomicina. Streptococcus pneumoniae presentó 100% de sensibilidad a vancomicina. Conclusiones. La frecuencia de patógenos provenientes de diferentes fluidos corporales no ha variado considerablemente. Sin embargo, el cambio más notable se observó en la resistencia, tanto en Gram positivos como en Gram negativos, en contra de los fármacos convencionales, así como en los considerados de amplio espectro.

Background. The increased resistance of microorganisms to antibiotics has led to an increase in morbidity and mortality from infections, increased use of antibiotics and excessive hospitalization costs. Therefore, the aim of this study was to describe the frequency of pathogens and bacterial susceptibility patterns in cultures of blood, urine and other body fluids in a tertiary pediatric hospital. We also aimed to determine the patterns of resistance in pathogens of clinical interest isolated in blood, urine and other sterile liquids in a pediatric teaching center and third-level hospital. Methods. The Institutional Antimicrobial Surveillance Program was established to monitor the predominant pathogens and antimicrobial susceptibility patterns of infections such as bacteremia, pneumonia and urinary infections. The species of each isolate was determined according to routine methodology and Vitek system from January 2010 to June 2011. Antimicrobial agents and susceptibility testing were determined using the Vitek 2XL according to the Clinical and Laboratory Standards Institute. Results. We recovered 7708 isolates from 27,209 cultures (28.3%). Gram negative represented 52.7%. A rank order showed Staphylococcus coagulase-negative , Escherichia coli, Enterococcus spp ., Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae and others. The antimicrobial susceptibility of the most frequently encountered pathogens was variable. E. coli showed the highest resistance to trimethopim-sulfamethoxazole and ampicillin-sulbactam (74 and 68%, respectively) finding the best option to be nitrofurantoin and imipenem with 84 and 100% sensitivity, respectively. Enterococcus faecium resistance was 58% vancomycin, and Streptococcus pneumoniae showed 100% sensitivity to vancomycin. Conclusions. This study emphasizes the problem of resistance and the needs to select an appropriate broad-spectrum empirical regimen guided by the knowledge of pathogen occurrences and local/regional/global resistance patterns. Such practices require the interrelation between clinical microbiology laboratories and hospital pharmacies.

Expresión atípica en la detección y cuantificación del virus de Epstein-Barr utilizando PCR en tiempo real / Atypic expression in the detection and quantification of Epstein-Barr virus using real-time PCR

Introducción. La carga viral del virus de Epstein-Barr (VEB) no solamente sirve para detectar una infección activa, sino también como marcador tumoral de ciertas formas malignas. En los pacientes inmunocomprometidos está relacionado con el síndrome linfoproliferativo postrasplante (SLPT) y la incidencia se encuentra en el orden de 1 a 20%. Se recomienda la determinación de la carga viral del VEB en sangre total y plasma para dar seguimiento a los pacientes en riesgo de padecer el SLPT; para esto, se utiliza como herramienta la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (PCR-TR). El objetivo de este trabajo es describir los hallazgos de las variaciones identificadas en el genoma del VEB al realizar la detección y cuantificación en muestras de pacientes pediátricos, utilizando la tecnología de PCR-TR. Métodos. Se analizaron retrospectivamente los resultados de 352 pacientes pediátricos a los que se les había realizado la detección y cuantificación del VEB en sangre periférica y plasma por medio de PCR-TR. Se amplificó un fragmento de 166 pb del genoma, utilizando un diseño de la compañía TIB MOLBIOL y el equipo LightCycler®, con una temperatura específica de desnaturalización (Tm) de 68 °C. Resultados. De los 352 pacientes estudiados, se detectó la presencia del VEB en 132 (37.5%) y se cuantificó la carga viral. En 5 de los pacientes positivos (3.8%), se identificó un cambio de la Tm. Por medio de electroforesis en gel de agarosa, se comprobó que el amplificado obtenido corresponde al fragmento de 166 pb. Conclusiones. Consideramos que puede existir una disminución en la concentración de guanina-citosina (G-C) en la secuencia blanco, ya que la Tm sufrió una disminución en todos los casos reportados. Sin embargo, se requiere la secuenciación de los amplificados para determinar con precisión la causa de disminución en la Tm.

Background. Epstein-Barr virus (EBV) viral load is useful not only for detection of an active infection but also as a tumor marker for certain malignant forms. In immunocompromised patients it is related to postransplant lymphoproliferative syndrome (PTLS) with an incidence on the order of 1 to 20%. It is recommended to determine viral load in whole blood and plasma to monitor patients at risk for developing PTLS. Real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) is a useful tool for this determination. In these determinations the melting curve (Tm) plays an important role because changes in Tm suggest that the target sequence has suffered mutations, although the selected regions for detection and quantification of EBV are highly conserved. We undertook this study to describe the findings of the variations identified in the EBV genome and to perform the detection and quantification in samples of pediatric patients using RT-PCR. Methods. Results from 352 pediatric patients were analyzed retrospectively in whom investigation of the EBV was performed in peripheral blood and plasma by RT-PCR. For detection and quantification of EBV, a 166-bp fragment of the genome was amplified using a design of TIB MOLBIOL and the LightCycler® equipment with a Tm of 68 °C. Results. Of the 352 patients studied, in 132 (37.5%) presence of EBV was detected and quantified the viral load. In five (3.8%) of the positive patients, a change of the Tm was identified Using electrophoresis running in agarose gel, it was proved that the obtained amplification corresponds to the 166-bp fragment. Conclusion. The specific product and size of the amplified remained unchanged; therefore, we there is a high probability of decrease in the concentration of guanine-cytosine in the target sequence because the Tm showed a decrease in all the reported cases. It is required the sequence of the amplification is required to precisely determine the cause of the decrease in the Tm.